Цитата: А если в 2015 году, с января по апрель 2015 г - работали 2 человека, потом с мая - только генеральный директор - нужны 2 документа?
Смотря как они были оформлены и смотря по каким должностям.
Если должность одна и таже и оформлены были эти 2 человека в пределах 1,0 ставки (например, 2 * 0,5 ставки), то - почему нет? Вы не вышли за пределы ставки, установленной по штатному расписанию. Но я сомневаюсь, что у Вас было оформлено 2 генеральных директора по 0,5 ставки.
Соответственно, скорее всего, у Вас оформлены были эти 2 человека на РАЗНЫЕ должности. Тогда возникает вопрос - Как у Вас могли работать 2 человека по разным должностям, если у Вас в ШР только одна должность - генеральный директор (Вы сами об этом написали). Так нельзя.
Тогда должно быть штатное расписание с указанием этих должностей.